Dalam rangka Penyelenggaraan Tridharma Perguruan Tinggi Fakultas Perikanan Universitas Alkhairaat mempunyai struktur organisasi dan personalia sebagai berikut:
Pimpinan Fakultas
Dr. Fachrudin A.. Yahya, S.Pi., M.Si.
Dekan
-
Wakil Dekan Bidang Akademik dan Kemahasiswaan
-
Wakil Dekan II Bidang Umum dan Keuangan
-
Kepala Unit Penjaminan Mutu Fakultas (UPMF)
-
Kepala Unit Tata Usaha (Kasubag Akademik dan Umum)